Doctor Arquitecto y Catedrático de Proyectos Arquitectónicos en la Escuela Técnica Superior de Arquitectura de Madrid (ETSAM)), desde 2002. Iñaki Abalos también ha sido Kenzo Tange Proffesor, Design Critic in Architecture y, desde 2013, Professor in Residence y Chair del Departmento de Arquitectura en la Graduate School of Design (GSD) de la Universidad de Harvard.
Además, ha sido profesor visitante en la Universidad de Columbia, la Architectural Association (AA) de Londres, la École Polytechnique Féderale de Lausanne (EPFL), la Universidad de Princeton y la Universidad de Cornell.
En 2006, y en asociación con Renata Sentkiewicz, fundó Abalos+Sentkiewicz. El trabajo que desarrollan destaca por proponer una síntesis original de rigor técnico, imaginación formal e integración disciplinar entre arquitectura, medio ambiente y paisaje, un enfoque que han denominado «Una belleza termodinámica».
